بلوک جراحی مرکزی بیمارستان پاسارگاد در پنج طبقه طراحی شده که سه طبقه آن به مجموعه مرکزی تالار جراحی اختصاص دارد. در این مجموعه، ۲۶ اتاق عمل شامل ۲۵ اتاق عمل فعال و یک اتاق عمل رزرو پیشبینی شده است.
اتاقهای عمل در سه طبقه اول، سوم و چهارم بلوک B سازماندهی شدهاند. در طبقه اول، ۹ اتاق عمل برای حوزههای تروما، سر و بازسازی و قفسه سینه طراحی شده که شامل چهار اتاق عمل تروما، سه اتاق عمل سر و بازسازی و یک اتاق عمل قفسه سینه به همراه یک اتاق رزرو است.
در طبقه سوم، هشت اتاق عمل تخصصی برای جراحیهای قلب و عروق، دستگاه گوارش و ادراری پیشبینی شده که پنج اتاق آن به قلب و عروق و سه اتاق به جراحیهای دستگاه گوارش و ادراری اختصاص خواهد داشت.
طبقه چهارم نیز شامل ۹ اتاق عمل تخصصی در حوزههای زنان، مامایی، اطفال، سیستم عصبی، اسکلتی و حرکتی خواهد بود.
در کنار مجموعه اتاقهای عمل، مرکز استریلیزاسیون مرکزی بیمارستان (CSSD)، مسیرهای مجزای انتقال استریل و کثیف و آسانسورهای اختصاصی نیز در طراحی پیشبینی شدهاند. همچنین سامانه مدیریت اتاق عمل (ORMS) برای برنامهریزی اعمال جراحی، هماهنگی تیمهای درمانی، مدیریت ظرفیت و پایش عملکرد اتاقهای عمل در نظر گرفته شده است.
این ساختار، بلوک B را به یکی از محورهای اصلی ارائه خدمات جراحی تخصصی و فوقتخصصی بیمارستان پاسارگاد تبدیل خواهد کرد.